Das Käppele ist auch losgelöst von der katholischen Kirche ein Wahrzeichen der Stadt Würzburg und als solches zu erhalten. Das ist der Kompromiss, dem der Stadtrat zustimmte. Demnach kommen der Wallfahrtskirche auf dem Nikolausberg in den kommenden drei Jahren je 50.000 Euro zugute. Ursprünglich waren im interfraktionellen Stadtratsantrag je 100.000 Euro gefordert. Daraufhin wurden Bedenken laut, dass auch andere Kirchen künftig mehr Geld von der Stadt fordern könnten. Das Geld fließt in die Sanierung, die rund 6 Millionen Euro kosten soll. Die Innenräume des Käppele sind stark verrußt und verstaubt. Weitere Fördermittel kommen aus einem Denkmalschutz-Fond und von einem Würzburger Förderkreis.